胚胎干细胞有着极其强大的分化能力，它能够分化成人体的各种细胞或组织。早期胚胎干细胞在人体内慢慢分化发育，最终发育成完整的个体。现今市面上大部分的美容机构所采用的都是胚胎干细胞美容，这也是其一种用途。
其次，胚胎干细胞也被用于医疗方面，在某些疑难杂症上面很多专家都束手无策，但是胚胎干细胞的出现就为其提供了解决办法。
由于其特殊的结构，胚胎干细胞将来可用于克隆动物这一方面，从而拯救该国濒临灭绝的动物。还有转基因动物也可以用胚胎干细胞进行研究，器官组织移植用于临床研究并取得了不错的成绩。此外，胚胎干细胞在临床研究还有很多个方面等待着开发。
